98年6月，高雄醫學大學所有系所悉數通過97學年度的大學系所評鑑，為系所評鑑以來獲得全數通過的兩所大學之一。同時在去年6月《商業周刊》公布2009百大良醫名單，高雄醫學大學校長余幸司獲得「超推薦百大好醫師」的殊榮。
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