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目前所知S. maltophilia對抗微生物藥劑的抗藥性，已知可能有下列機轉： 1.產生β-lactamase對β-lactam類抗生素抗藥性 S. maltophilia能製造兩種可誘導產生 (inducible)的β-lactamases：L1 β-lactamase 和 L2 β-lactamase。

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