民國36年5月改組為台灣省菸酒公賣局澎湖營業所,又於同年9月1日改為台灣省菸酒公賣局澎湖辦事處,民國54年改稱台灣省菸酒公賣局澎湖分局。隨著菸酒公賣民營化,現為台灣菸酒股份有限公司高雄營業處馬公營運站。
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